С момента первичного размещения акций (IPO) в феврале 2013 года руководство Биржи постоянно совершенствует корпоративное управление, стремясь занять достойное место среди глобальных торговых площадок.

Действующая на Бирже система корпоративного управления создана в соответствии с требованиями законодательства к Бирже как организатору торговли, требованиями Правил листинга к Бирже как эмитенту, ценные бумаги которого допущены к организованным торгам, а также с учетом рекомендаций Кодекса корпоративного управления Банка России, принципов корпоративного управления Организации экономического сотрудничества и развития (ОЭСР) и лучших практик в области корпоративного управления.

Система корпоративного управления Биржи служит эффективным инструментом для обеспечения защиты законных прав и интересов всех акционеров Биржи, а также пользователей ее услуг. На сегодняшний день также создана и активно развивается система управления рисками и внутреннего контроля, основанная на использовании самых современных технологических решений, покрывающих все аспекты операционной деятельности Биржи.

В 2014 году Банк России признал Биржу вместе с НРД и Банком НКЦ системно значимыми инфраструктурными организациями финансового рынка.