Общее собрание акционеров является высшим органом управления Биржи. На Общем собрании акционеров принимаются решения по основным вопросам ее деятельности.

Перечень вопросов, относящихся к компетенции Общего собрания акционеров, определен Федеральным законом Российской Федерации «Об акционерных обществах» и Уставом Биржи.

В соответствии с введенной в 2015 году практикой проведения годовых Общих собраний акционеров в апреле, в 2016 году Биржей 27 апреля было проведено годовое Общее собрание акционеров Биржи, которое приняло следующие решения:

• утвердить годовой отчет, а также годовую бухгалтерскую (финансовую) отчетность Биржи за 2015 год;
• утвердить в новой редакции Устав Биржи с учетом изменений в законодательстве и в сфере корпоративного управления;
• утвердить новые версии Положений о порядке подготовки, созыва и проведения Общего собрания акционеров, о Наблюдательном совете и Ревизионной комиссии;
• избрать членов Наблюдательного совета и Ревизионной комиссии;
• утвердить новую редакцию Положения о вознаграждении и компенсации расходов членов Наблюдательного совета Биржи и принять решения о выплате вознаграждения членам Наблюдательного совета и Ревизионной комиссии за 2015–2016 корпоративный год;
• одобрить сделки с дочерними компаниями Биржи и постоянными партнерами Биржи, которые в соответствии с действующим законодательством признаются сделками с заинтересованностью;
• утвердить аудитора на 2016 год – компанию ООО «Эрнст энд Янг Внешаудит», входящую в четверку крупнейших международных аудиторских организаций;
• принять решения о распределении прибыли и выплате дивидендов за 2015 год в размере 7,11 рубля на одну обыкновенную именную акцию;
• одобрить заключение соглашения об условиях участия Биржи в Гарантийном фонде, формируемом Банком НКЦ в целях управления рисками.

2 сентября 2016 года также было проведено одно внеочередное Общее собрание акционеров, которое приняло решение о реорганизации Биржи в форме присоединения к ней двух стопроцентно дочерних компаний – ЗАО «ФБ ММВБ» и ООО «МБ Технологии», а также внесены актуальные изменения в Устав Биржи.